Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms