Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms