Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfc3h1B2RT41 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfc3h1B2RT41 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms