Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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