Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms