Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms