Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Skint4A7TZF3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms