Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn3aA2ASI5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms