Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga8A2ARA8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms