Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms