Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rbbp8nlA2ABX0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms