Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms