Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trav12-2A0N8N6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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