Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms