Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trbv2A0A0B4J1G8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trbv2A0A0B4J1G8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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