Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Homer1Q9Z2Y3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms