Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms