Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms