Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr1Q9Z2C4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr1Q9Z2C4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtmr1Q9Z2C4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms