Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Pdpk1Q9Z2A0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Pdpk1Q9Z2A0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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