Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms