Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ror1Q9Z139 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ror1Q9Z139 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ror1Q9Z139 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ror1Q9Z139 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ror1Q9Z139 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms