Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms