Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apobec2Q9WV35 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms