Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Usp18Q9WTV6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Usp18Q9WTV6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Usp18Q9WTV6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Usp18Q9WTV6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Usp18Q9WTV6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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