Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms