Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms