Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rfwd2Q9R1A8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfwd2Q9R1A8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms