Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BcamQ9R069 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms