Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nubp2Q9R061 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nubp2Q9R061 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nubp2Q9R061 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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