Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms