Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms