Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Col4a3Q9QZS0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms