Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms