Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clcf1Q9QZM3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms