Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms