Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms