Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms