Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms