Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms