Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms