Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Thsd1Q9JM61 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd1Q9JM61 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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