Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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