Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms