Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms