Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms