Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms