Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms