Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc12a4Q9JIS8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms