Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LratQ9JI60 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LratQ9JI60 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms